Die Temperatur ist der Parameter mit dem größten Einfluss auf die Inaktivierung vieler Viren. Inaktivierungsraten nehmen sowohl für freie Viren im Wasser als auch für an Sedimentpartikel haftende Viren mit steigender Temperatur zu. Dies hat zur Folge, dass Viren im Allgemeinen im Oberflächengewässer im Winter länger infektiös bleiben als im Sommer. Die Empfindlichkeit von freien Viren im Wasser gegenüber Temperaturänderungen ist allerdings stark von der jeweiligen Virusart abhängig (Schijven und Hassanizadeh, 2000), weshalb keine allgemeinen Angaben zur Temperaturabhängigkeit der Inaktivierung möglich sind. Hinzu kommt, dass die Schwankungen der Wassertemperatur im Untergrund mit zunehmender Tiefe abnehmen und somit bei der Untergrundpassage der Einfluss der jahreszeitlichen Temperaturkurven gedämpft wird. Da die Temperatur zwar einen großen Einfluss auf die Inaktivierung von Viren, jedoch nur einen geringen Einfluss auf deren Sorption bzw. Transport hat, wird hier nicht weiter darauf eingegangen (der Focus dieses EUS liegt ausschließlich auf Transport und Rückhalt, nicht auf der Inaktivierung von Viren).